73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2517 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  98.2 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  87.43 
 
 		 167 aa  309  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  68.71 
 
 		 164 aa  250  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  68.15 
 
 		 164 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  67.52 
 
 		 164 aa  231  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  62.8 
 
 		 164 aa  228  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  61.73 
 
 		 164 aa  226  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  65.61 
 
 		 165 aa  224  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  61.35 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  62.42 
 
 		 164 aa  222  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  61.49 
 
 		 164 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  53.89 
 
 		 171 aa  188  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  51.25 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  35.66 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  39.34 
 
 		 184 aa  91.3  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  36.3 
 
 		 192 aa  89  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  36.24 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  34.27 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  34.93 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  34.25 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  34.03 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  32.41 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  32.41 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  35 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  32.41 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  29.66 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  31.51 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  32.65 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  31.51 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  30.71 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  31.72 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  30.82 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  31.85 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  32.19 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  30.72 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  35.37 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  32.89 
 
 		 195 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  30.92 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  30.92 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  36.08 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  30.07 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  30.57 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  28.1 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  27.78 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  32.65 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  27.45 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  28 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  34 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  27.15 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  28.3 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  34 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  29.25 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  30.22 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  28.77 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  27.41 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  29.14 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  29.32 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  27.01 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  27.61 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  30.87 
 
 		 275 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  25.83 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  28.15 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  27.21 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  27.21 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  27.52 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>