62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1070 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  100 
 
 		 172 aa  347  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  72.35 
 
 		 170 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  64.1 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  54.11 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  51.03 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  48.1 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  40.43 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  30.82 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  31.45 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  29.94 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  30.82 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  33.75 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  33.75 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  31.45 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  27.56 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  28.48 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  30.97 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  28.48 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  28.48 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  28.3 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  29.01 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  31.29 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  29.73 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  29.58 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  28.17 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  25.64 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  26.67 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  26.71 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  29.17 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  27.03 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  29.25 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  25 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  27.95 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  29.25 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  28.38 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  29.73 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  26.71 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  25.17 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  29.63 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  25.68 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  27.03 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  25.68 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  27.74 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  27.16 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  28.38 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  25 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  25.35 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  26.39 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  24.83 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  26.87 
 
 		 257 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  24.05 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  25.35 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  24.31 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  25 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  24.32 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  26.06 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  24.32 
 
 		 177 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  26.43 
 
 		 307 aa  41.6  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  26.06 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2621  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  26.35 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>