276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2437 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  80 
 
 
159 aa  256  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  73.72 
 
 
157 aa  238  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  58.97 
 
 
156 aa  190  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  59.09 
 
 
154 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  60 
 
 
154 aa  183  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  60 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  57.69 
 
 
157 aa  179  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  55.84 
 
 
159 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  55.84 
 
 
159 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  55.84 
 
 
159 aa  178  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  55.84 
 
 
159 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  55.84 
 
 
159 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  55.13 
 
 
156 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  56.49 
 
 
157 aa  177  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  57.52 
 
 
158 aa  176  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  56.21 
 
 
159 aa  175  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  55.84 
 
 
161 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  57.05 
 
 
157 aa  175  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  58.97 
 
 
156 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  55.84 
 
 
159 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  55.19 
 
 
156 aa  173  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  56.69 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  57.79 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  57.89 
 
 
160 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  54.49 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  53.9 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  57.05 
 
 
158 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  57.79 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  57.05 
 
 
158 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  55.77 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  55.19 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  55.41 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  55.77 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  57.79 
 
 
157 aa  171  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  56.86 
 
 
158 aa  170  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  55.19 
 
 
154 aa  169  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  53.5 
 
 
160 aa  168  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  55.13 
 
 
159 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  53.85 
 
 
156 aa  168  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  55.19 
 
 
154 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  53.21 
 
 
157 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  53.21 
 
 
157 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  52.56 
 
 
157 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  56.21 
 
 
158 aa  167  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  56.21 
 
 
172 aa  167  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  55.19 
 
 
158 aa  166  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  54.49 
 
 
158 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  54.49 
 
 
158 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  54.49 
 
 
158 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  54.49 
 
 
158 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  54.49 
 
 
158 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  55.19 
 
 
158 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  55.19 
 
 
158 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  53.21 
 
 
157 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  55.19 
 
 
158 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  55.19 
 
 
159 aa  164  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  55.84 
 
 
154 aa  164  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  55.19 
 
 
157 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  54.55 
 
 
158 aa  164  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  55.19 
 
 
159 aa  163  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  54.55 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  53.9 
 
 
159 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  50.65 
 
 
161 aa  161  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  53.59 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  53.25 
 
 
159 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  53.02 
 
 
180 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  53.9 
 
 
159 aa  160  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  53.9 
 
 
159 aa  160  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  53.69 
 
 
224 aa  160  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  160  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  53.02 
 
 
159 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  53.9 
 
 
158 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0948  bacterioferritin  55.41 
 
 
157 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.811124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  53.21 
 
 
158 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  48.7 
 
 
168 aa  158  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0944  bacterioferritin  55.41 
 
 
157 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0982  bacterioferritin  55.41 
 
 
157 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136664  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1111  bacterioferritin subunit 2  55.41 
 
 
157 aa  157  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  58.39 
 
 
157 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>