285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3342 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  99.39 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  90.3 
 
 		 165 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  85.09 
 
 		 161 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  83.85 
 
 		 161 aa  281  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  84.47 
 
 		 161 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  83.23 
 
 		 161 aa  279  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  68.32 
 
 		 161 aa  227  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  68.32 
 
 		 161 aa  226  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  68.94 
 
 		 161 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  68.94 
 
 		 161 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  68.94 
 
 		 161 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  67.08 
 
 		 161 aa  221  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  65.84 
 
 		 161 aa  216  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  65.84 
 
 		 161 aa  216  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  66.67 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  66 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  66.67 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  66 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  62.96 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  67.79 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  67.11 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  62.96 
 
 		 165 aa  207  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  67.11 
 
 		 160 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  66 
 
 		 165 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  66 
 
 		 165 aa  205  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  66 
 
 		 165 aa  204  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  66.44 
 
 		 159 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  62.67 
 
 		 161 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  64.43 
 
 		 161 aa  200  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  61.33 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  57.05 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  57.05 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  54.43 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  54.78 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  52.83 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  54.78 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  53.16 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  55.03 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  68.03 
 
 		 122 aa  171  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  55.7 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  55.7 
 
 		 154 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  53.69 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  55.03 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  51.68 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  53.02 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  53.69 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  53.69 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  53.69 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  55.03 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  53.69 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  51.68 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  53.02 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  53.02 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  51.01 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  53.02 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  54.36 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  50.34 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  53.02 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  53.02 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  53.02 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  53.02 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  53.02 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  53.02 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  51.9 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  55.7 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  51.01 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  52.83 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  53.02 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  48.32 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  51.57 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  53.02 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  51.01 
 
 		 154 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  52 
 
 		 154 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  53.69 
 
 		 157 aa  153  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  48.99 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  48.17 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  51.01 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  52.35 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  52.35 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  51.01 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  50.34 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  51.01 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  49.66 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  52.35 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  50.34 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  51.68 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  51.68 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  51.68 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  51.68 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  47.47 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  47.65 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  47.47 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  47.47 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  51.68 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  49.37 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  51.01 
 
 		 157 aa  150  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  49.37 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  49.37 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  49.37 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>