287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3026 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  87.58 
 
 
161 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  86.96 
 
 
161 aa  290  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  84.47 
 
 
165 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  83.23 
 
 
165 aa  279  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  83.23 
 
 
165 aa  278  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  80.75 
 
 
161 aa  274  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  68.94 
 
 
161 aa  230  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  67.7 
 
 
161 aa  229  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  67.7 
 
 
161 aa  228  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  67.7 
 
 
161 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  68.32 
 
 
161 aa  228  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  67.08 
 
 
161 aa  226  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  67.08 
 
 
161 aa  226  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  66.46 
 
 
161 aa  224  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  64 
 
 
159 aa  207  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  66.44 
 
 
160 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  65.33 
 
 
160 aa  205  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  64.67 
 
 
160 aa  204  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  64.67 
 
 
165 aa  204  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  64.43 
 
 
160 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  65.1 
 
 
160 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  66.21 
 
 
165 aa  202  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  64 
 
 
165 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  60.87 
 
 
165 aa  200  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  64.14 
 
 
165 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  63.09 
 
 
159 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  63.09 
 
 
161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  59.01 
 
 
165 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  61.07 
 
 
154 aa  189  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  60 
 
 
161 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  56.38 
 
 
168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  56 
 
 
159 aa  179  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  56.69 
 
 
158 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  54.36 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  55.7 
 
 
159 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  53.69 
 
 
159 aa  169  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  66.39 
 
 
122 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  54.36 
 
 
154 aa  166  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  50.63 
 
 
158 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  54.36 
 
 
154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  55.03 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  51.68 
 
 
158 aa  163  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  53.69 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  52.67 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  50.96 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  52.67 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  50.31 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  52.67 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  51.68 
 
 
159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  54.36 
 
 
159 aa  160  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  51.68 
 
 
158 aa  160  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  51.68 
 
 
159 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  51.68 
 
 
158 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  52.35 
 
 
158 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  51.68 
 
 
158 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  50.34 
 
 
158 aa  157  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  50.34 
 
 
158 aa  157  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  47.83 
 
 
165 aa  156  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  51.68 
 
 
156 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  52.32 
 
 
156 aa  156  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  53.69 
 
 
159 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  51.9 
 
 
159 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  53.69 
 
 
158 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  50.34 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  50.33 
 
 
154 aa  154  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  51.66 
 
 
156 aa  154  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  51.01 
 
 
180 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  49.33 
 
 
159 aa  154  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  51.68 
 
 
224 aa  153  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  52.35 
 
 
158 aa  153  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  52.35 
 
 
158 aa  153  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  52.35 
 
 
158 aa  153  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  48.99 
 
 
159 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  54.36 
 
 
157 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  48.32 
 
 
160 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  50.34 
 
 
159 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  51.68 
 
 
159 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  48.99 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  51.01 
 
 
160 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  49.67 
 
 
154 aa  150  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  51.68 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>