286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3765 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  100 
 
 
159 aa  327  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  83.54 
 
 
160 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  81.01 
 
 
160 aa  274  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  81.13 
 
 
159 aa  273  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  80.38 
 
 
161 aa  270  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  80.38 
 
 
160 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  75.32 
 
 
160 aa  260  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  72.15 
 
 
160 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  74.68 
 
 
165 aa  250  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  74.05 
 
 
165 aa  247  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  73.42 
 
 
165 aa  246  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  72.78 
 
 
165 aa  244  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  71.07 
 
 
159 aa  243  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  73.42 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  70.44 
 
 
161 aa  239  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  71.52 
 
 
165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  66.67 
 
 
165 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  66 
 
 
165 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  65.33 
 
 
161 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  64 
 
 
161 aa  207  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  64.67 
 
 
161 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  65.56 
 
 
161 aa  206  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  64.9 
 
 
161 aa  204  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  64 
 
 
165 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  63.58 
 
 
161 aa  202  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  63.58 
 
 
161 aa  202  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  64.9 
 
 
161 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  63.58 
 
 
161 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  63.58 
 
 
161 aa  200  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  62.25 
 
 
161 aa  197  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  58.86 
 
 
160 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  62 
 
 
161 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  58.6 
 
 
158 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  60.13 
 
 
159 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  58.33 
 
 
158 aa  186  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  58.33 
 
 
158 aa  186  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  56.33 
 
 
158 aa  186  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  60.26 
 
 
154 aa  183  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  56.41 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  56.69 
 
 
158 aa  180  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  57.14 
 
 
168 aa  180  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  56.95 
 
 
160 aa  177  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  54.78 
 
 
159 aa  173  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  57.69 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  57.69 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  59.31 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  57.79 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  57.69 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  57.69 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  57.69 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  58.28 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  56.49 
 
 
159 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  58.28 
 
 
157 aa  170  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  52.87 
 
 
158 aa  170  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  53.21 
 
 
158 aa  169  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  53.16 
 
 
158 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  53.64 
 
 
159 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  52.9 
 
 
158 aa  168  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  53.64 
 
 
158 aa  168  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  58.62 
 
 
154 aa  167  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  56.29 
 
 
154 aa  167  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  53.16 
 
 
224 aa  167  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  52.53 
 
 
180 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  55.77 
 
 
157 aa  167  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  58.62 
 
 
154 aa  167  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  51.9 
 
 
159 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  51.9 
 
 
158 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  53.16 
 
 
158 aa  167  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  52.53 
 
 
159 aa  167  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  52.6 
 
 
154 aa  166  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  57.93 
 
 
156 aa  167  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  53.85 
 
 
158 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  53.85 
 
 
158 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  53.25 
 
 
159 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  53.16 
 
 
158 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  54.97 
 
 
157 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  54.97 
 
 
157 aa  165  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  53.25 
 
 
159 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  54.97 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>