279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0565 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  95.65 
 
 
161 aa  314  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  81.99 
 
 
161 aa  274  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  81.99 
 
 
161 aa  273  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  81.99 
 
 
161 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  81.37 
 
 
161 aa  265  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  77.02 
 
 
161 aa  262  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  71.43 
 
 
161 aa  233  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  68.32 
 
 
165 aa  226  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  67.08 
 
 
161 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  66.46 
 
 
161 aa  222  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  66.46 
 
 
161 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  65.84 
 
 
165 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  65.84 
 
 
165 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  62.5 
 
 
160 aa  206  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  65.56 
 
 
160 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  63.92 
 
 
160 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  63.58 
 
 
159 aa  202  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  64.9 
 
 
165 aa  201  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  64.24 
 
 
165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  61.39 
 
 
160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  64.24 
 
 
165 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  62.25 
 
 
161 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  63.58 
 
 
165 aa  198  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  60.25 
 
 
165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  62.91 
 
 
165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  63.09 
 
 
160 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  62.25 
 
 
159 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  58.94 
 
 
154 aa  186  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  56.05 
 
 
159 aa  184  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  56.95 
 
 
159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  56.95 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  52.53 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  55.63 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  70.49 
 
 
122 aa  171  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  53.21 
 
 
159 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  51.27 
 
 
158 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  51.27 
 
 
158 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  55.63 
 
 
158 aa  167  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  51.59 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  50.31 
 
 
159 aa  164  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  54.36 
 
 
156 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  51.27 
 
 
158 aa  163  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  53.64 
 
 
159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  52.87 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  55.13 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  50.94 
 
 
165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  54.97 
 
 
158 aa  160  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  49.67 
 
 
158 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  52.98 
 
 
156 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  53.5 
 
 
157 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  52.32 
 
 
157 aa  158  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  49.68 
 
 
158 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  52.32 
 
 
157 aa  158  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  51.59 
 
 
160 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  51.01 
 
 
159 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  52.32 
 
 
154 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  53.02 
 
 
156 aa  156  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  52.98 
 
 
158 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  52.98 
 
 
158 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  50.63 
 
 
158 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  50.63 
 
 
158 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  50.63 
 
 
158 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  50.63 
 
 
158 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  50.63 
 
 
158 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  51.66 
 
 
159 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  50.94 
 
 
159 aa  154  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  50.94 
 
 
161 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  53.64 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  51.28 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  52.32 
 
 
158 aa  154  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  50.31 
 
 
159 aa  154  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  50.99 
 
 
154 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  52.32 
 
 
158 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  49.01 
 
 
154 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  51.66 
 
 
158 aa  153  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  47.8 
 
 
159 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  51.66 
 
 
158 aa  153  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  49.68 
 
 
158 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  51.66 
 
 
158 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  54.3 
 
 
157 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  50.99 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  50.99 
 
 
158 aa  150  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  48 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  49.66 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  48 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  48 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  51.01 
 
 
156 aa  150  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  48.99 
 
 
154 aa  150  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  52.32 
 
 
158 aa  150  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  50.99 
 
 
158 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  50.99 
 
 
158 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  50.99 
 
 
158 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  51.66 
 
 
172 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  50.99 
 
 
158 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  50.99 
 
 
158 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  48.99 
 
 
154 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>