284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4212 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  100 
 
 
161 aa  327  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  98.14 
 
 
161 aa  322  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  87.58 
 
 
161 aa  293  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  88.2 
 
 
161 aa  293  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  84.47 
 
 
161 aa  285  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  83.23 
 
 
161 aa  280  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  81.99 
 
 
161 aa  274  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  81.99 
 
 
161 aa  274  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  70.81 
 
 
161 aa  230  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  67.7 
 
 
161 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  68.94 
 
 
165 aa  226  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  68.94 
 
 
165 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  68.32 
 
 
165 aa  225  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  67.08 
 
 
161 aa  221  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  67.08 
 
 
161 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  63.58 
 
 
159 aa  201  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  63.58 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  64.24 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  62.91 
 
 
160 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  62.91 
 
 
165 aa  193  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  62.25 
 
 
165 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  59.38 
 
 
160 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  62.25 
 
 
160 aa  191  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  62.25 
 
 
165 aa  191  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  60.26 
 
 
161 aa  190  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  60.93 
 
 
165 aa  188  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  61.59 
 
 
159 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  58.39 
 
 
165 aa  186  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  60.26 
 
 
165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  56.95 
 
 
154 aa  178  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  54.3 
 
 
161 aa  174  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  55.06 
 
 
168 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  54.3 
 
 
159 aa  170  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  54.97 
 
 
159 aa  167  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  54.97 
 
 
160 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  55.7 
 
 
161 aa  164  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  65.57 
 
 
122 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  50.31 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  53.69 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  50.96 
 
 
158 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  52.53 
 
 
158 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  50.63 
 
 
158 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  50.32 
 
 
159 aa  157  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  50.94 
 
 
159 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  54.97 
 
 
158 aa  157  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  51.01 
 
 
159 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  50.32 
 
 
159 aa  156  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  50.99 
 
 
154 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  52.35 
 
 
156 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  52.9 
 
 
156 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  51.66 
 
 
160 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  52.32 
 
 
158 aa  154  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  50.65 
 
 
159 aa  154  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  51.68 
 
 
160 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  52.9 
 
 
156 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  49.69 
 
 
160 aa  150  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  50.99 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  54.3 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  48.67 
 
 
159 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  48.67 
 
 
159 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  48.67 
 
 
159 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  51.68 
 
 
156 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  50.99 
 
 
157 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  50.99 
 
 
157 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  48.73 
 
 
158 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  48.99 
 
 
159 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  49.66 
 
 
156 aa  147  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  52.32 
 
 
159 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  50.33 
 
 
154 aa  148  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  51.59 
 
 
159 aa  148  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  54.3 
 
 
157 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  47.33 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  52.32 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  50.99 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  50.33 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  50.99 
 
 
224 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  49.04 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  49.04 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  49.04 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  49.01 
 
 
158 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  48.32 
 
 
154 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  48.73 
 
 
158 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  49.67 
 
 
158 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  50.99 
 
 
157 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  50.99 
 
 
157 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  48.32 
 
 
154 aa  144  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  50.99 
 
 
157 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  50.33 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  49.67 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  49.67 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  50.99 
 
 
157 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  50.33 
 
 
159 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>