294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0882 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  100 
 
 
168 aa  340  5.999999999999999e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  67.53 
 
 
154 aa  220  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  61.78 
 
 
158 aa  203  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  60.76 
 
 
158 aa  201  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  57.32 
 
 
160 aa  191  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  59.09 
 
 
154 aa  189  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  59.09 
 
 
159 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  56.52 
 
 
161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  56.52 
 
 
161 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  187  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  58.44 
 
 
159 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  57.67 
 
 
159 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  54.27 
 
 
165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  59.09 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  57.79 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  57.96 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  59.74 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  56.6 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  57.96 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  57.96 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  57.62 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  58.44 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  54.04 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  57.05 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  58.44 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  56.69 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  52.8 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  57.79 
 
 
154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  58.44 
 
 
180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  53.7 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  58.44 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  56.41 
 
 
157 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  53.7 
 
 
165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  56.49 
 
 
154 aa  180  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  180  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  57.14 
 
 
159 aa  180  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  55.41 
 
 
158 aa  180  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  57.79 
 
 
224 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  56.33 
 
 
158 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  55.35 
 
 
159 aa  178  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  57.79 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  55.06 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  57.14 
 
 
157 aa  178  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  56.77 
 
 
158 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  52.2 
 
 
159 aa  178  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  53.99 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  53.99 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  56.49 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  177  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  56.49 
 
 
159 aa  177  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  56.95 
 
 
159 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  57.14 
 
 
158 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  57.14 
 
 
158 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  55.28 
 
 
161 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  52.8 
 
 
161 aa  175  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  55.19 
 
 
157 aa  175  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  52.8 
 
 
161 aa  175  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  55.19 
 
 
165 aa  175  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  55.19 
 
 
157 aa  175  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  55.19 
 
 
158 aa  174  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  55.19 
 
 
158 aa  174  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  55.19 
 
 
158 aa  174  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  55.84 
 
 
165 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  55.19 
 
 
157 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  55.19 
 
 
160 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  174  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  59.09 
 
 
157 aa  174  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  52.8 
 
 
161 aa  174  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  54.55 
 
 
157 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  53.9 
 
 
157 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  53.25 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  55.33 
 
 
156 aa  173  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  53.5 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  53.94 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  53.33 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  54.04 
 
 
161 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>