283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0616 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  100 
 
 		 161 aa  328  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  83.85 
 
 		 165 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  83.23 
 
 		 165 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  83.85 
 
 		 165 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  80.75 
 
 		 161 aa  274  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  80.12 
 
 		 161 aa  269  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  79.5 
 
 		 161 aa  267  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  70.19 
 
 		 161 aa  233  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  71.43 
 
 		 161 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  71.43 
 
 		 161 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  70.19 
 
 		 161 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  71.43 
 
 		 161 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  70.81 
 
 		 161 aa  230  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  70.19 
 
 		 161 aa  230  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  70.19 
 
 		 161 aa  227  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  68.87 
 
 		 165 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  68.87 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  64.6 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  68.21 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  67.55 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  63.35 
 
 		 165 aa  206  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  67.55 
 
 		 160 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  65.56 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  66.23 
 
 		 160 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  67.11 
 
 		 160 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  66.23 
 
 		 159 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  62.25 
 
 		 160 aa  198  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  62.25 
 
 		 160 aa  197  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  64.24 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  61.59 
 
 		 161 aa  195  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  59.6 
 
 		 159 aa  191  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  58.94 
 
 		 154 aa  184  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  53.8 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  72.13 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  55.63 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  53.8 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  54.97 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  54.97 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  54.09 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  54.14 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  54.3 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  50.94 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  54.3 
 
 		 156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  53.64 
 
 		 154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  50.63 
 
 		 158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  55.63 
 
 		 159 aa  163  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  54.97 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  51.95 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  51.9 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  51.9 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  50.32 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  49.01 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  52.98 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  52.32 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  52.32 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  52.32 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  53.64 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  53.64 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  53.64 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  53.64 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  53.69 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  53.64 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  54.36 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  51.66 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  52.98 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  48.45 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  51.66 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  50.32 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  52.32 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  52.2 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  51.92 
 
 		 157 aa  153  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  50.99 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  51.92 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  51.57 
 
 		 172 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  50.99 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  51.27 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  50.63 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  51.66 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  50.63 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  51.66 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  50.99 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  50.34 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  50.63 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  50.33 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  50.33 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  48.73 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  48.73 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  48.73 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  48.34 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  50.97 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>