273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1102 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  100 
 
 
165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  90.91 
 
 
165 aa  312  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  89.7 
 
 
165 aa  306  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  87.88 
 
 
165 aa  304  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  87.88 
 
 
165 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  87.27 
 
 
165 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  72.33 
 
 
161 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  72.61 
 
 
159 aa  240  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  71.52 
 
 
159 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  68.35 
 
 
160 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  67.72 
 
 
160 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  68.15 
 
 
161 aa  227  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  65.19 
 
 
160 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  68.15 
 
 
159 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  63.29 
 
 
160 aa  222  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  64.56 
 
 
160 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  63.58 
 
 
165 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  62.8 
 
 
165 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  62.96 
 
 
165 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  63.35 
 
 
161 aa  206  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  60.25 
 
 
161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  60.25 
 
 
161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  59.01 
 
 
161 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  62.76 
 
 
161 aa  192  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  59.01 
 
 
161 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  62.07 
 
 
161 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  60.93 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  60.26 
 
 
161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  57.76 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  57.14 
 
 
161 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  56.13 
 
 
160 aa  180  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  58.67 
 
 
161 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  53.8 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  53.8 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  55.84 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  57.05 
 
 
156 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  54.55 
 
 
154 aa  166  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  51.52 
 
 
159 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  55.63 
 
 
158 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  50.97 
 
 
158 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  50.94 
 
 
159 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  52.98 
 
 
160 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  54.3 
 
 
154 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  55.19 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  56.38 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  55.03 
 
 
156 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  53.9 
 
 
158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  53.9 
 
 
158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  50 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  53.64 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  50.91 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  50.91 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  55.7 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  51.66 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  49.68 
 
 
159 aa  160  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  51.95 
 
 
154 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  50 
 
 
158 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  51.97 
 
 
158 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  51.95 
 
 
159 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  52.6 
 
 
158 aa  157  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  52.6 
 
 
158 aa  157  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  52.6 
 
 
158 aa  157  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  52.6 
 
 
158 aa  157  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  47.74 
 
 
158 aa  157  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  52.6 
 
 
158 aa  157  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  49.69 
 
 
159 aa  157  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  54.84 
 
 
157 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  54.3 
 
 
172 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  49.36 
 
 
158 aa  156  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  50 
 
 
159 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  50.97 
 
 
158 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  53.64 
 
 
158 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  47.74 
 
 
158 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  51.95 
 
 
158 aa  155  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  51.3 
 
 
156 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  48.08 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  52.6 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  50 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  51.3 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  51.3 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  53.64 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  49.36 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  51.3 
 
 
158 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  49.03 
 
 
159 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  47.47 
 
 
158 aa  153  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  48.72 
 
 
180 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  48.73 
 
 
159 aa  153  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  49.36 
 
 
224 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  51.3 
 
 
158 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  50.65 
 
 
157 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>