285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4273 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  100 
 
 		 161 aa  328  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  85.71 
 
 		 161 aa  290  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  84.47 
 
 		 161 aa  285  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  83.85 
 
 		 161 aa  281  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  81.99 
 
 		 161 aa  278  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  77.64 
 
 		 161 aa  266  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  77.02 
 
 		 161 aa  262  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  77.02 
 
 		 161 aa  262  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  70.19 
 
 		 161 aa  233  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  68.32 
 
 		 165 aa  226  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  68.32 
 
 		 165 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  66.46 
 
 		 161 aa  224  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  65.22 
 
 		 165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  63.98 
 
 		 161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  63.98 
 
 		 161 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  64.9 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  62.91 
 
 		 160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  64.24 
 
 		 160 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  62.25 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  63.58 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  63.76 
 
 		 160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  62.25 
 
 		 160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  60.93 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  61.59 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  61.59 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  61.59 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  60.93 
 
 		 165 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  57.76 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  56.95 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  57.76 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  56.95 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  58.28 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  59.6 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  59.6 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  53.8 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  67.21 
 
 		 122 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  52.53 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  52.23 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  51.9 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  55.7 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  50.31 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  53.16 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  53.16 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  52.87 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  49.69 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  51.25 
 
 		 160 aa  155  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  53.02 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  50.32 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  51.68 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  52.98 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  50.99 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  50.99 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  52.8 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  51.61 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  49.06 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  52.32 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  56.29 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  51.68 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  49.37 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  52.9 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  50.34 
 
 		 156 aa  151  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  50.99 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  52.32 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  50.33 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  52.32 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  52.98 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  52.32 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  52.32 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  52.32 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  52.32 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  51.66 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  50.33 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  50.33 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  50.33 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  48 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  51.66 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  49.01 
 
 		 154 aa  147  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  51.66 
 
 		 157 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  49.67 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  49.66 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  51.66 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  49.01 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  49.01 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  49.01 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  49.01 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  48.32 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  49.01 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  49.67 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  49.01 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>