279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4048 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  100 
 
 
161 aa  326  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  88.2 
 
 
161 aa  293  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  87.58 
 
 
161 aa  293  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  85.09 
 
 
161 aa  284  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  81.99 
 
 
161 aa  278  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  83.23 
 
 
161 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  81.37 
 
 
161 aa  265  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  81.37 
 
 
161 aa  265  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  68.32 
 
 
161 aa  228  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  70.19 
 
 
161 aa  227  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  68.32 
 
 
165 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  68.94 
 
 
165 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  68.94 
 
 
165 aa  225  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  66.46 
 
 
161 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  66.46 
 
 
161 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  62 
 
 
159 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  63.76 
 
 
160 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  61.33 
 
 
160 aa  187  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  61.74 
 
 
160 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  60.67 
 
 
165 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  61.74 
 
 
160 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  61.07 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  60 
 
 
160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  59.73 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  60 
 
 
165 aa  180  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  60 
 
 
165 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  60 
 
 
165 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  58.67 
 
 
165 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  57.05 
 
 
154 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  58.67 
 
 
165 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  55.33 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  56.38 
 
 
160 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  55.03 
 
 
159 aa  165  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  53.75 
 
 
161 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  55.03 
 
 
168 aa  164  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  51.33 
 
 
159 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  66.39 
 
 
122 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  55.03 
 
 
160 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  52.35 
 
 
159 aa  157  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  51.9 
 
 
158 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  50.31 
 
 
165 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  51.68 
 
 
159 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  50.63 
 
 
158 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  52.32 
 
 
156 aa  154  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  54.36 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  50.67 
 
 
159 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  53.02 
 
 
160 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  50.67 
 
 
159 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  50.34 
 
 
158 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  50.94 
 
 
160 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  50.67 
 
 
159 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  50.67 
 
 
159 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  51.68 
 
 
159 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  51.68 
 
 
154 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  52.35 
 
 
158 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  150  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  150  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  53.02 
 
 
159 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  47.8 
 
 
159 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  55.03 
 
 
156 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  50.34 
 
 
160 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  51.01 
 
 
156 aa  148  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  53.69 
 
 
157 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  53.02 
 
 
158 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  53.69 
 
 
157 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  53.69 
 
 
157 aa  147  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  51.01 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  51.01 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  52.35 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  51.01 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  53.02 
 
 
157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  48.99 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  50.34 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  50.34 
 
 
159 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  49.68 
 
 
156 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  53.02 
 
 
157 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  52.35 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  51.01 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  51.01 
 
 
158 aa  143  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  50.34 
 
 
158 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  49.66 
 
 
157 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  50.34 
 
 
158 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  49.33 
 
 
154 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  49.66 
 
 
157 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  48.99 
 
 
159 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  48.43 
 
 
157 aa  140  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  48.43 
 
 
157 aa  140  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  51.68 
 
 
158 aa  140  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  48.99 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  48.99 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  51.01 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  48.99 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  53.69 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  48.99 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  48.99 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  48.43 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  47.65 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  48.99 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  48.32 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>