282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6042 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  100 
 
 		 160 aa  327  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  68.15 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  66.25 
 
 		 160 aa  214  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  63.69 
 
 		 161 aa  213  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  61.88 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  61.64 
 
 		 159 aa  209  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  60.51 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  60.51 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  60.51 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  60.51 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  61.64 
 
 		 160 aa  198  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  57.23 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  53.5 
 
 		 157 aa  168  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  53.55 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  52.63 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  55.03 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  53.69 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  52.35 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  53.69 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  54.49 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  53.69 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  54.36 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  50.63 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  50.31 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  54.67 
 
 		 156 aa  160  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  51.68 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  52.23 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  55.03 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  51.59 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  51.59 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  53.02 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  53.02 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  52.67 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  51.59 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  51.68 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  53.33 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  52.6 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  50.34 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  49.66 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  50.34 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  51.33 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  50.67 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  51.33 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  48.99 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  48.03 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  48.99 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  51.01 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  51.32 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  48.32 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  51.72 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  47.65 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  48.32 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  51.03 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  51.37 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  52 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  48.1 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  48.75 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  50 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  50 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  52.67 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  46.98 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  52.41 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  52.41 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  49.34 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  50.67 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  50.67 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  50.65 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  50.34 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  50.67 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  49.04 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  52.41 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  49.06 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  50 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  48.67 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  48.68 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  50.32 
 
 		 172 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  50.34 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  53.29 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  51.72 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  48.41 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  46.84 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  48.41 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  48.41 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  48.41 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  49.33 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  48.41 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  48.41 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  46.31 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>