291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2818 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  100 
 
 		 159 aa  319  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  80 
 
 		 157 aa  256  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  77.56 
 
 		 157 aa  251  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  59.48 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  58.06 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  54.9 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  53.85 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  59.06 
 
 		 160 aa  176  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  58.71 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  53.59 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  53.21 
 
 		 159 aa  173  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  52.29 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  52.29 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  52.29 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  51.63 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  56.76 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  52.56 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  56.38 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  53.59 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  53.55 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  52.26 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  53.85 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  54.61 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  54.19 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  55.56 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  54.97 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  52.9 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  52.94 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  52.56 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  52.26 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  52.56 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  52.56 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  50.64 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  51.92 
 
 		 157 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  51.92 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  53.55 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  48.34 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  51.32 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  51.63 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  51.63 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  49.02 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  51.25 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  50.64 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  52.94 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  51.63 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  50.98 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  49.67 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  51.59 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  51.35 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  50.64 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  49.67 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  49.02 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  49.36 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  49.36 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  49.36 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  49.36 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  50.98 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  49.36 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  50.98 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  50.98 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  50.98 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  50.98 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  50 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  50.64 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  49.02 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  49.02 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  53.06 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  50 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  49.67 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  55.41 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  49.67 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  49.03 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  49.32 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  49.32 
 
 		 158 aa  146  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  49.32 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  48.65 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  48.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  48.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  48.99 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  48.65 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  48.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  48.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  48.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  48.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  48.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  48.65 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>