287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4423 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  100 
 
 
156 aa  314  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  58.33 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  65.38 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  57.05 
 
 
159 aa  193  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  57.05 
 
 
159 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  58.97 
 
 
157 aa  190  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  54.55 
 
 
161 aa  183  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  58.06 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  57.24 
 
 
160 aa  180  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  56.49 
 
 
154 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  53.29 
 
 
159 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  55.26 
 
 
159 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  55.26 
 
 
159 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  53.29 
 
 
159 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  56.41 
 
 
158 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  53.29 
 
 
159 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  53.29 
 
 
159 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  55.13 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  54.55 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  55.13 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  53.9 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  54.49 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  53.85 
 
 
157 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  55.13 
 
 
156 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  53.85 
 
 
157 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  55.13 
 
 
157 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  52.63 
 
 
165 aa  166  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  52.63 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  50.97 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  53.59 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  52 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  51.33 
 
 
160 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  54.49 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  51.92 
 
 
160 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  51.95 
 
 
157 aa  159  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  53.85 
 
 
159 aa  158  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  50.65 
 
 
159 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  53.25 
 
 
157 aa  157  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  53.25 
 
 
157 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  53.25 
 
 
157 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  53.33 
 
 
154 aa  157  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  52.6 
 
 
159 aa  157  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  52.26 
 
 
160 aa  157  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  51.3 
 
 
156 aa  157  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  53.33 
 
 
154 aa  157  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  52.6 
 
 
155 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  51.92 
 
 
158 aa  156  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  52.56 
 
 
158 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  49.36 
 
 
156 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  50 
 
 
157 aa  155  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  46.79 
 
 
161 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  50.64 
 
 
158 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  50.64 
 
 
158 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  50 
 
 
157 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  53.02 
 
 
161 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  47.4 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  51.68 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  51.95 
 
 
159 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  51.3 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  51.01 
 
 
161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  50.65 
 
 
156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  50.65 
 
 
156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  51.01 
 
 
161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  51.3 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  48.72 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  51.28 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  52.29 
 
 
172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  48.72 
 
 
158 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  150  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  150  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  50.65 
 
 
159 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  48.72 
 
 
158 aa  150  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  52.29 
 
 
158 aa  150  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  50.65 
 
 
159 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  48.72 
 
 
158 aa  150  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  48.7 
 
 
159 aa  150  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  51.68 
 
 
161 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  50 
 
 
154 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  51.01 
 
 
161 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  48.32 
 
 
158 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  49.03 
 
 
157 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  47.4 
 
 
168 aa  148  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  51.01 
 
 
161 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  48.72 
 
 
159 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  46.75 
 
 
155 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  50.65 
 
 
158 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  49.03 
 
 
157 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  46.79 
 
 
160 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  50 
 
 
158 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  48.99 
 
 
154 aa  147  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  51.01 
 
 
161 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  50 
 
 
158 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  46.98 
 
 
161 aa  147  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  49.03 
 
 
158 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  47.44 
 
 
160 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  46.79 
 
 
160 aa  146  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>