262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3758 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  51.25 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  49.68 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  46.79 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  50.65 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  50.31 
 
 		 180 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  50.31 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  50.31 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  50.31 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  50.31 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  50.31 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  50.31 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  48.32 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  49.69 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  50.31 
 
 		 224 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  49.69 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  49.69 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  49.69 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  45.51 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  47.44 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  48.05 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  48.43 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  47.77 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  48 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  49.03 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  48 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  46.79 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  45.81 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  49.33 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  46.5 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  44.87 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  48.05 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  48.39 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  46.79 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  46.79 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  46.79 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  46.84 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  46.79 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  46.79 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  48.05 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  46.75 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  46.75 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  46.75 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  46.75 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  46.75 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  45.81 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  46.45 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  48.05 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  48.05 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  46.75 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  46.75 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  46.75 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  47.4 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  45.28 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  45.57 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  46.15 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  46.79 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  46.1 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  46.15 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  45.64 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  46.1 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  44.16 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  48.08 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  43.59 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  45.51 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  45.81 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  43.87 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  46.79 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  44.23 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  44.23 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  43.95 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  44.94 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  45.64 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  42.31 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  45.51 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  46.75 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  45.45 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  47.33 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  45.16 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  47.33 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  44.23 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  47.44 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  43.59 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  46.31 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  46.31 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  45.33 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  45.22 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  42.5 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  42.31 
 
 		 168 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  42.5 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  46.31 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  49.02 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  45.33 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  42.86 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  42.86 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  45.16 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>