287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0465 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  98.06 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  76.62 
 
 		 155 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  72.73 
 
 		 155 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  63.64 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  54.9 
 
 		 154 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  50 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  45.81 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  51.95 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  50.67 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  46.75 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  45.45 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  47.4 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  47.74 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  47.65 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  44.52 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  45.45 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  44.81 
 
 		 159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  43.87 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  47.33 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  43.23 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  42.21 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  46.1 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  46 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  45.45 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  43.87 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  46.1 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  46.1 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  46.1 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  46.1 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  46.1 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  44.81 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  44.16 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  45.45 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  48 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  48 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  42.58 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  45.16 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  44.52 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  44.67 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  44.52 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  46.1 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  41.94 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  45.64 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  45.64 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  44.52 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  42.86 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  45.64 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  43.87 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  42.48 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  46 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  44.16 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  42.58 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  44.37 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  45.64 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  44.16 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  41.33 
 
 		 165 aa  120  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  44 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  44.16 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  43.87 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  43.87 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  43.62 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  42.95 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  45.33 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  45.16 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  46 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  44.81 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  44.81 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  41.56 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  42.28 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  43.51 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  43.51 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  44.16 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  45.91 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  44.16 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  44.81 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  44.16 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  44.16 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  44.16 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  39.35 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  39.35 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  41.29 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  41.29 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  41.61 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  41.29 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  42.95 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  43.51 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  42.95 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  42.95 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  44.16 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  42.86 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  43.51 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  42.58 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  41.29 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>