256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2201 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2201  Ferritin and Dps  100 
 
 		 122 aa  248  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  72.13 
 
 		 161 aa  177  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  68.85 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  70.49 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  70.49 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  70.49 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  68.03 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  68.03 
 
 		 165 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  67.21 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  66.39 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  65.57 
 
 		 161 aa  166  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  65.57 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  65.57 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  64.75 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  66.39 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  63.93 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  67.86 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  62.18 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  62.5 
 
 		 165 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  63.11 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  61.67 
 
 		 165 aa  151  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  60.66 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  61.67 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  65.18 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  59.66 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  60.5 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  57.85 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  66.96 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  62.5 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  64.29 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  65.45 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  63.39 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  58.04 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  58.26 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  52.21 
 
 		 168 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  56.25 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  55.66 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  54.55 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  55 
 
 		 156 aa  123  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  53.45 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  51.79 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  52.59 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  52.46 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  51.72 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  52.46 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  51.26 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  53.33 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  55.17 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  53.57 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  56.64 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  52.68 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  51.64 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  52.5 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  52.5 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  54.1 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  53.57 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  49.18 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  51.79 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  52.73 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  51.72 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  54.46 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  52.94 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  50.91 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  52.68 
 
 		 157 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  49.17 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  51.64 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  55.66 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  51.82 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  51.82 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  52.68 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  50.86 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  52.83 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  52.83 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  60.38 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  50 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  50.89 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  51.79 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  49.11 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  49.11 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  49.11 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  49.11 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  53.57 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  50 
 
 		 224 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  49.11 
 
 		 180 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  49.11 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  49.11 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  55.24 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  52.68 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  50.43 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  49.11 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  55.24 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  49.17 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  52.68 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  48.21 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  48.21 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  48.21 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  48.21 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>