70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0839 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  100 
 
 
275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  88.73 
 
 
275 aa  501  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  85.09 
 
 
275 aa  488  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  31.67 
 
 
307 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1134  Rubrerythrin  30.14 
 
 
309 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000119671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  33.86 
 
 
179 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  32.17 
 
 
177 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  32.17 
 
 
177 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  32.09 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 
194 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1748  Ferritin Dps family protein  34.82 
 
 
168 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0346837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  35.82 
 
 
162 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  29.86 
 
 
181 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  29.17 
 
 
184 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 
181 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  28.67 
 
 
179 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  30.67 
 
 
187 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  28.99 
 
 
180 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  31.34 
 
 
179 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  30.66 
 
 
176 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  34.65 
 
 
159 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
179 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 
191 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  33.07 
 
 
161 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  29.37 
 
 
176 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
176 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  29.37 
 
 
168 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
176 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  31.3 
 
 
169 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  33.07 
 
 
161 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  30.88 
 
 
185 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  30.88 
 
 
185 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  30.95 
 
 
160 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  34.68 
 
 
160 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  32.28 
 
 
161 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  30.4 
 
 
160 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  32.54 
 
 
165 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  27.46 
 
 
174 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  33.33 
 
 
160 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
181 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  31.75 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  30.94 
 
 
138 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  31.5 
 
 
161 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  27.41 
 
 
192 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  31.75 
 
 
165 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
196 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  26.11 
 
 
168 aa  46.2  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  31.54 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  33.33 
 
 
157 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1481  manganese containing catalase  31.53 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000413774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  32.31 
 
 
165 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  32.54 
 
 
161 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  28.99 
 
 
179 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  30.15 
 
 
187 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  29.81 
 
 
160 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  28.23 
 
 
159 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  28.8 
 
 
161 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  32.26 
 
 
190 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  28.47 
 
 
142 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  28.57 
 
 
159 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4490  hypothetical protein  34.72 
 
 
506 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0688012 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  30.95 
 
 
165 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  31.72 
 
 
164 aa  42.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  26.32 
 
 
179 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  26.06 
 
 
181 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  27.42 
 
 
159 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  31.75 
 
 
154 aa  42  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  27.42 
 
 
159 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  27.42 
 
 
159 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>