37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1134 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1134  Rubrerythrin  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000119671  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  53.72 
 
 
307 aa  329  4e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  33.45 
 
 
275 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  30.14 
 
 
275 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  28.98 
 
 
275 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  26.35 
 
 
179 aa  52.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  26.76 
 
 
179 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  27.03 
 
 
179 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  29.85 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
169 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  27.66 
 
 
179 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  27.21 
 
 
199 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1645  cotJC protein  34.31 
 
 
171 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  27.61 
 
 
181 aa  49.3  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  27.61 
 
 
181 aa  49.3  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  26.87 
 
 
184 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  25.33 
 
 
164 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  24.83 
 
 
177 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  24.83 
 
 
177 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  26.06 
 
 
191 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  26.24 
 
 
174 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  25.98 
 
 
154 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  26.77 
 
 
168 aa  46.2  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  26.28 
 
 
171 aa  46.2  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  25.19 
 
 
142 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  23.29 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  25.66 
 
 
164 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  25.37 
 
 
186 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  25.17 
 
 
164 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  25.37 
 
 
138 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  25.74 
 
 
180 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  24.14 
 
 
186 aa  43.5  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  24.83 
 
 
179 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  23.18 
 
 
164 aa  42.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  23.53 
 
 
164 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 
229 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  23.49 
 
 
164 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>