265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1387 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  70.76 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  68.39 
 
 		 199 aa  254  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  66.67 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  66.08 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  65.5 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  62.42 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  36.77 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  37.42 
 
 		 160 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  39.52 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  36.17 
 
 		 161 aa  88.2  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  35.46 
 
 		 158 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  37.86 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  36.49 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  33.33 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  36.17 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  33.8 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  35.38 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  30.07 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  36.17 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  30.07 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  30.07 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  36.91 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  32.03 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  32.47 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  35.46 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  33.77 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  31.91 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  33.8 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  30.92 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  35.46 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  32.68 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  31.79 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  33.12 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  31.79 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  31.79 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  34.04 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  31.76 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  32.88 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  35.66 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  29.87 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  35.61 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  35.38 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  32.16 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  34.04 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  33.59 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  32.16 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  33.33 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  32.19 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  34.04 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  34.29 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  29.93 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  34.35 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  32.24 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  33.77 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  31.87 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  32 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  32.14 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  33.1 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  32.86 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  33.59 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  31.87 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  33.1 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  34.69 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  31.21 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  31.55 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  31.72 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  32.86 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  30.77 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  30.71 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  32.82 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  30.71 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  33.07 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  32.86 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  34.35 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  32.41 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  32.41 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  31.54 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  33.59 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  31.94 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1229  Ferritin Dps family protein  32.37 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  31.33 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  34.11 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  30.5 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  29.38 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  34.65 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  33.86 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  29.38 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  29.38 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  33.33 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  28.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  28.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  28.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  28.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  28.75 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  31.5 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  28.75 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>