233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0133 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  100 
 
 
179 aa  371  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  72.32 
 
 
179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  71.84 
 
 
199 aa  263  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  70.93 
 
 
179 aa  260  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  67.98 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  66.67 
 
 
179 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  64.6 
 
 
169 aa  229  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  36.13 
 
 
160 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  34.57 
 
 
161 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  39.06 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  35.92 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  32.86 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  32.69 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1229  Ferritin Dps family protein  37.41 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  32.39 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  34.04 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  32.62 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  34.64 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  30.46 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  32.62 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  30.26 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  30.26 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  30.26 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  32.89 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  31.91 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  33.33 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  33.33 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  29.22 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  28.29 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  32.37 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  31.88 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  28.29 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  28.29 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  30.07 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  32.37 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  33.1 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  31.41 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  33.33 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  34.25 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  27.89 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  31.25 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  30.2 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  29.66 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  31.47 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  30.5 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  32.39 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  30.94 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  30.52 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  29.79 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  32.24 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  29.79 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  30.46 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  31.72 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  28.76 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  29.08 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  29.79 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  30.22 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  29.66 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  29.08 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  29.79 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  31.65 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  30.99 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  31.91 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  30.87 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  30.94 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  26.62 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  30.5 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  29.79 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  31.21 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  31.43 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  28.37 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  30.88 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  27.34 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  26.62 
 
 
161 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  31.65 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  29.79 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  27.86 
 
 
158 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  26.43 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  25.71 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  28.3 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  28.77 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  30 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  26.35 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2242  bacterioferritin  30.22 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  27.67 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  27.67 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  30.94 
 
 
158 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  30.41 
 
 
159 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  29.5 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  27.5 
 
 
158 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  30.94 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  29.93 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  30.94 
 
 
158 aa  54.3  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  27.14 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  25.53 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  26.88 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  28.57 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  26.76 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  27.94 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  26.88 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>