247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0293 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
179 aa  370  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  75.28 
 
 
179 aa  286  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  78.49 
 
 
199 aa  286  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  70.93 
 
 
179 aa  260  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  66.47 
 
 
179 aa  248  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  65.5 
 
 
179 aa  240  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  58.13 
 
 
169 aa  208  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  35 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  32.9 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  34.46 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  32.86 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  32.86 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  32.26 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  32.86 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  35.16 
 
 
138 aa  79  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  33.99 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  31.37 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  30.72 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  30.72 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  30.97 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  33.78 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  33.78 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  31.41 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  32.43 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  31.54 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1229  Ferritin Dps family protein  33.53 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  34.64 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  31.17 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  30.07 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  31.91 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  29.94 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  32.26 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  32.14 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  30.5 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  32.62 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  29.79 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  30.97 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  30 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  30.34 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  29.45 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  33.1 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  31.29 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  33.33 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  32.59 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  33.1 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  26.97 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  27.63 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  29.75 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  27.63 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  29.22 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  32.21 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  29.75 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  28.97 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  29.77 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  27.89 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  32.45 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  29.38 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  30.67 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  28.57 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  29.77 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  31.54 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  27.95 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  29.29 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  29.01 
 
 
159 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  27.14 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  29.29 
 
 
161 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  30.57 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  33.33 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  28.38 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  28.86 
 
 
161 aa  62  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  29.5 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  29.49 
 
 
160 aa  61.6  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  28.24 
 
 
160 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  30.61 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  28.57 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  28.57 
 
 
155 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  28.85 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  29.73 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  29.23 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  29.03 
 
 
158 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  29.03 
 
 
158 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  24.65 
 
 
159 aa  57.8  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  30.88 
 
 
307 aa  57  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  29.11 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  29.11 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  29.61 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  28.36 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  30 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  28.35 
 
 
141 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  29.11 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  32.84 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  29.73 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  28.48 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  32 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  27.7 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  32 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  31.03 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  28.77 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  28.77 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  29.05 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>