247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1675 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 		 179 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  82.66 
 
 		 199 aa  304  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  75.28 
 
 		 179 aa  286  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  72.32 
 
 		 179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  70.76 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  69.32 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  60.25 
 
 		 169 aa  218  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  33.55 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  34.64 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  32.68 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  36.24 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  31.37 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  33.33 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  32.92 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  34.11 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  34.11 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  34.11 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  32.47 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  33.78 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  35.37 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  31.17 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1229  Ferritin Dps family protein  35.93 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  32.19 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  33.78 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  36.22 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  34.35 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  34.35 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  31.01 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  35.43 
 
 		 155 aa  72  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  31.85 
 
 		 161 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  32.65 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  28.66 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  32.9 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  34.23 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  30.28 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  29.22 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  29.22 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  31.17 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  30 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  32.62 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  30.13 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  33.59 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  33.09 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  29.7 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  30.13 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  28.57 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  29.19 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  34.81 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  33.59 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  34.69 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  32.84 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  32.82 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  32.06 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  28.57 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  30.94 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  30.28 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  33.1 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  30.94 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  31.43 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  29.81 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  30.82 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  30.82 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  30.99 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  33.33 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  30.99 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  30.99 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  30.99 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  30.71 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  28.57 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  32.82 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  30.94 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  30.22 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  30.53 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  31.17 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  32.09 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  30.22 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  30 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  30.22 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  30.22 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  29.3 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  30.22 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  30.22 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  30.22 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  30.22 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  30.22 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  31.79 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  29.75 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  30.25 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  29.58 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  29.38 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  33.33 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  29.11 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  28.87 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  28.67 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  31.03 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  31.29 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>