112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1315 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1134  Rubrerythrin  53.72 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000119671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  34.39 
 
 
275 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  31.67 
 
 
275 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  30.73 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  30 
 
 
154 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  29.41 
 
 
179 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  32.54 
 
 
159 aa  59.7  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  32.58 
 
 
169 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
138 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  29.41 
 
 
179 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
179 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  29.86 
 
 
165 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  30.88 
 
 
179 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  29.23 
 
 
165 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  29.92 
 
 
165 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  28.12 
 
 
168 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  29.61 
 
 
154 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  29.13 
 
 
165 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1748  Ferritin Dps family protein  31.96 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0346837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  28.79 
 
 
199 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  28.57 
 
 
165 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  30.3 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  30.3 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  30.3 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  30.3 
 
 
224 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  30.3 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  30.3 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  30.3 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  30.3 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  30.3 
 
 
180 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  28.28 
 
 
160 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  27.91 
 
 
165 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  30.15 
 
 
142 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1645  cotJC protein  31.73 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  26.49 
 
 
160 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  29.55 
 
 
158 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  29.55 
 
 
158 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  29.55 
 
 
158 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  29.55 
 
 
158 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  31.06 
 
 
158 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  25.17 
 
 
154 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  29.55 
 
 
158 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  29.55 
 
 
158 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  30.23 
 
 
179 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  27.13 
 
 
158 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  26.47 
 
 
186 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  29.55 
 
 
159 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  26.28 
 
 
181 aa  48.9  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  28.46 
 
 
158 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  27.2 
 
 
162 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  26.28 
 
 
181 aa  48.9  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  25.83 
 
 
160 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  27.34 
 
 
184 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  26.77 
 
 
161 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  26.36 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  26.36 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  28.79 
 
 
159 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  27.46 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  27.46 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  27.91 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  28.46 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  26.77 
 
 
159 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  26.36 
 
 
159 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  27.56 
 
 
156 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  27.69 
 
 
159 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  24.6 
 
 
160 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  28.03 
 
 
159 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  28 
 
 
160 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  29.2 
 
 
164 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  25.58 
 
 
158 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  25.58 
 
 
154 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  28.57 
 
 
159 aa  45.8  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  26.36 
 
 
172 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  26.15 
 
 
194 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  24.63 
 
 
174 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  28.37 
 
 
161 aa  45.8  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  29.46 
 
 
158 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  27.66 
 
 
161 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  26.72 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  25.98 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  26.72 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  26.72 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  27.48 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  28.57 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  27.66 
 
 
161 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  25 
 
 
160 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  28.03 
 
 
155 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  28.8 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  27.78 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  26.24 
 
 
159 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  26.56 
 
 
157 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  26.56 
 
 
157 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  25.58 
 
 
156 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  24.26 
 
 
192 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  25.98 
 
 
157 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  26.72 
 
 
155 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  26.56 
 
 
157 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  27.08 
 
 
154 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>