12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1645 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1645  cotJC protein  100 
 
 
171 aa  358  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1748  Ferritin Dps family protein  28.4 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0346837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  29.93 
 
 
229 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  31.73 
 
 
307 aa  51.6  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1134  Rubrerythrin  35.05 
 
 
309 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000119671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  26.16 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  23.39 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  25.15 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  23.84 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  21.76 
 
 
230 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  28.87 
 
 
324 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  24.4 
 
 
190 aa  40.8  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>