56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_826 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  88.73 
 
 		 275 aa  501  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  86.91 
 
 		 275 aa  494  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  30.73 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1134  Rubrerythrin  28.98 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000119671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  31.5 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  32.59 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  35.82 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  32.86 
 
 		 159 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  32.37 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  30.77 
 
 		 177 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  30.37 
 
 		 179 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1748  Ferritin Dps family protein  34.86 
 
 		 168 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0346837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  29.5 
 
 		 184 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  30.77 
 
 		 177 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  30.88 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  30.88 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 		 186 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  30.95 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  30.47 
 
 		 179 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  30 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  28.06 
 
 		 179 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  33.06 
 
 		 165 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  30.53 
 
 		 169 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  28.36 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  34.4 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  30.94 
 
 		 187 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  30.95 
 
 		 161 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  30.95 
 
 		 161 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  29.85 
 
 		 176 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  26.95 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  28.67 
 
 		 176 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  30.77 
 
 		 156 aa  45.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  29.6 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  28.67 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  28.8 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  30.95 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  29.37 
 
 		 159 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  28.17 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  28.15 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  29.71 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  30.95 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  27.78 
 
 		 159 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  27.82 
 
 		 179 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  33.06 
 
 		 157 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  30.16 
 
 		 165 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  26.98 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  26.43 
 
 		 174 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  30.95 
 
 		 154 aa  42.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  26.98 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  26.98 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  27.41 
 
 		 185 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  29.2 
 
 		 179 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>