267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2901 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  100 
 
 
187 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  65.03 
 
 
185 aa  267  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  65.38 
 
 
185 aa  264  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  71.68 
 
 
196 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  72.19 
 
 
181 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  71.51 
 
 
177 aa  257  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  69.05 
 
 
176 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  71.43 
 
 
177 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  68.45 
 
 
176 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  67.86 
 
 
176 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  67.26 
 
 
180 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  64.57 
 
 
179 aa  248  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  70.86 
 
 
190 aa  248  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  67.88 
 
 
168 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  68.42 
 
 
191 aa  246  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  65.48 
 
 
176 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  70.86 
 
 
190 aa  242  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  62.86 
 
 
192 aa  231  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  62.03 
 
 
186 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  55.62 
 
 
181 aa  213  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  55.62 
 
 
181 aa  213  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  60.36 
 
 
181 aa  210  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  59.52 
 
 
184 aa  210  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  59.06 
 
 
174 aa  206  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  56.42 
 
 
186 aa  206  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  54.17 
 
 
194 aa  197  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  56.8 
 
 
257 aa  192  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  48.3 
 
 
187 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  35.91 
 
 
182 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  33.57 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  32.19 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  32.39 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  31.94 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  31.43 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  30.82 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  31.51 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  33.56 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  34.93 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  27.34 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  32.84 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  26.53 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  29.14 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  30.41 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  33.77 
 
 
161 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  32 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  30.37 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  31.11 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  27.4 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  32.33 
 
 
157 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  31.79 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  33.11 
 
 
161 aa  57.8  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  32.62 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  31.97 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  33.11 
 
 
161 aa  57.8  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  32.64 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  31.11 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  33.1 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  31.58 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  31.03 
 
 
275 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  31.79 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  27.7 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  30.87 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  33.09 
 
 
165 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  30.94 
 
 
275 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  32.86 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  33.33 
 
 
161 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  33.09 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  33.09 
 
 
161 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  30.99 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  28.08 
 
 
154 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  30.2 
 
 
160 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  29.53 
 
 
159 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  29.8 
 
 
161 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  31.51 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  30.2 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  25.34 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  29.45 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  30.46 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  29.85 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  29.45 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0570  ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  30.08 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  31.29 
 
 
157 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  28.57 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  32.33 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  31.08 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  30.41 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  28.97 
 
 
142 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  33.81 
 
 
182 aa  52  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  25.34 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  31.62 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  29.8 
 
 
161 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>