245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0567 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  89.53 
 
 		 179 aa  318  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  84.66 
 
 		 176 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  84.09 
 
 		 176 aa  310  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  86.63 
 
 		 180 aa  308  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  83.52 
 
 		 176 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  85.12 
 
 		 168 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  74.43 
 
 		 177 aa  275  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  75 
 
 		 177 aa  275  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  65.48 
 
 		 187 aa  241  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  65.29 
 
 		 185 aa  234  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  65.29 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  65.48 
 
 		 191 aa  234  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  63.47 
 
 		 196 aa  230  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  63.25 
 
 		 181 aa  223  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  60.82 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  61.08 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  62.21 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  58.93 
 
 		 192 aa  211  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  62.79 
 
 		 190 aa  207  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  54.6 
 
 		 174 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  60.13 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  58.43 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  57.56 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  57.56 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  56.25 
 
 		 194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  53.57 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  48.81 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  35.5 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  35.66 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  34.27 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  34.21 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  34.69 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  38.3 
 
 		 138 aa  85.9  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  32.41 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  35.66 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  29.66 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  30.46 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  37.23 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  35.04 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  32.84 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  29.2 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  31.85 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  32.84 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  34.33 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  32.09 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  32.09 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  33.83 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  34.59 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  39.71 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  31.88 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  37.96 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  33.82 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  33.83 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  32.09 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  31.16 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  33.58 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  34.06 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  33.58 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  34.56 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  34.56 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  33.33 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  31.39 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  32.84 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  33.33 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  31.34 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  35.77 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  32.09 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  35.77 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  33.33 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  35.29 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  32.09 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  33.11 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  31.34 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  30.37 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  32.84 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  34.48 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  29.14 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  31.13 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  31.85 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  31.39 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  32.85 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  34.06 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  31.85 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  33.33 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  34.07 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  34.07 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  30.22 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  32.61 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  32.61 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  32.61 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  33.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  32.86 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  30.66 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>