125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0895 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
187 aa  384  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  51.45 
 
 
185 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  51.45 
 
 
185 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  49.11 
 
 
187 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  49.7 
 
 
192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  49.71 
 
 
176 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  47.93 
 
 
181 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  49.12 
 
 
176 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  45.86 
 
 
181 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  48.81 
 
 
191 aa  167  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  48.81 
 
 
180 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  49.4 
 
 
177 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  48.81 
 
 
177 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  50.89 
 
 
257 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  47.95 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  48.21 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  48.81 
 
 
176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  45.4 
 
 
196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  47.34 
 
 
174 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  48.48 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  49.72 
 
 
190 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  48.19 
 
 
184 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  46.63 
 
 
181 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  46.63 
 
 
181 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  50.28 
 
 
190 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  43.79 
 
 
186 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  47.47 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  46.99 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  43.18 
 
 
182 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  32.17 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  32.17 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  30.07 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  29.37 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  29.86 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  29.17 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  28.67 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
167 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
165 aa  61.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 
138 aa  60.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  31.16 
 
 
168 aa  52  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  28.75 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  26.71 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  29.66 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  26.09 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  30.28 
 
 
275 aa  47.8  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  33.33 
 
 
154 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  29.87 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0943  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0999203  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  30.2 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  27.07 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  31.91 
 
 
155 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  28.65 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  31.88 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  31.88 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  30.15 
 
 
275 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  29.25 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1087  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0929  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0914  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000508997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0897  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.911937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  29.71 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3659  Ferritin Dps family protein  29.17 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137978  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1069  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64861e-38 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  29.71 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  28.99 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0993  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  27.01 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  31.88 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  28.79 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  29.71 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  29.71 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  29.71 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  29.71 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  29.71 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  33.09 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  29.93 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  28.77 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  26.47 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  28.77 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  29.2 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  31.88 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  29.71 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  28.47 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  33.09 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  33.09 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  33.09 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  33.09 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  33.09 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1160  hypothetical protein  26.57 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  27.4 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  27.01 
 
 
160 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  28.26 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  29.37 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  27.39 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  22.7 
 
 
307 aa  42.4  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>