57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0254 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  100 
 
 
170 aa  350  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  72.35 
 
 
172 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  62.26 
 
 
165 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  47.95 
 
 
151 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  49.32 
 
 
167 aa  137  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  46.21 
 
 
151 aa  134  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  39.13 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  28.76 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  30.82 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  28.76 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  29.45 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  31.16 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  31.16 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  27.81 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  28.77 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  30.07 
 
 
183 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  30.37 
 
 
171 aa  54.7  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  31.65 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  30.66 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  30.77 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  25.53 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  26.95 
 
 
179 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  28.37 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  27.27 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  25.85 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  28.57 
 
 
179 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  27.4 
 
 
182 aa  47.8  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  27.4 
 
 
182 aa  47.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  26.43 
 
 
196 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  26.67 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  27.86 
 
 
168 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  27.14 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  26.17 
 
 
191 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  29.14 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  27.86 
 
 
176 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  27.78 
 
 
194 aa  44.3  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  29.14 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  25.93 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  26.47 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  26.39 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  28.26 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  27.14 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  28.48 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  25.74 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  28.15 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  32.63 
 
 
195 aa  42.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  27.46 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  27.61 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  27.14 
 
 
176 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  26.67 
 
 
164 aa  42  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  27.14 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1315  Rubrerythrin  27.86 
 
 
307 aa  41.6  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0388444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  28 
 
 
164 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1380  Ferritin Dps family protein  25.37 
 
 
141 aa  41.2  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1682  bacterioferritin  25.35 
 
 
147 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  25.93 
 
 
141 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>