225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2657 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
190 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  94.74 
 
 
190 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  81.48 
 
 
196 aa  324  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  81.36 
 
 
181 aa  298  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  72.35 
 
 
187 aa  263  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  67.2 
 
 
185 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  67.21 
 
 
185 aa  260  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  65.12 
 
 
191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  66.86 
 
 
177 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  66.27 
 
 
177 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  64.46 
 
 
180 aa  233  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  62.07 
 
 
176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  61.49 
 
 
176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  61.49 
 
 
176 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  63.47 
 
 
168 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  61.9 
 
 
179 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  62.35 
 
 
181 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  61.85 
 
 
176 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  59.06 
 
 
174 aa  214  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  56.18 
 
 
186 aa  206  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  57.3 
 
 
186 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  53.01 
 
 
192 aa  204  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  56.29 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  56.29 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  57.83 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  56.1 
 
 
194 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  57.4 
 
 
257 aa  185  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  49.72 
 
 
187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  39.55 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  36.05 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  35.33 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  34.69 
 
 
164 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  36.88 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  35.46 
 
 
164 aa  85.1  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  37.14 
 
 
138 aa  84.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  34.01 
 
 
164 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  35.46 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  35.46 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  31.72 
 
 
171 aa  82  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
167 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  34 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  34 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  25.35 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  32.33 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  29.71 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  32.41 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  28.57 
 
 
160 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  28.17 
 
 
154 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  29.1 
 
 
160 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  29.2 
 
 
160 aa  58.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  25.9 
 
 
154 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  25.9 
 
 
154 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  31.34 
 
 
158 aa  57.8  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  32.09 
 
 
161 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  31.47 
 
 
275 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  29.63 
 
 
159 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  31.58 
 
 
157 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  25.35 
 
 
154 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  31.58 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  31.43 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  29.1 
 
 
161 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  26.76 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  27.61 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  29.85 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  28.57 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  30.37 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  29.63 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  27.61 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4282  Ferritin and Dps  29.52 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000186191  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  30.37 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  32.12 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  29.85 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  28.57 
 
 
154 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  28.4 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  28.24 
 
 
176 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  28.15 
 
 
154 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  29.85 
 
 
160 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  27.14 
 
 
159 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  30.88 
 
 
165 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  30.83 
 
 
159 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  28.36 
 
 
158 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  27.61 
 
 
160 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  30.83 
 
 
159 aa  51.6  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  29.1 
 
 
161 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  27.82 
 
 
161 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  26.47 
 
 
199 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  25.74 
 
 
179 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  27.82 
 
 
154 aa  51.2  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  29.37 
 
 
275 aa  51.2  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  25.87 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  29.29 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  29.29 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  26.72 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  29.29 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  25.17 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  25.17 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>