188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0139 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  97.3 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  68.6 
 
 		 187 aa  261  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  67.05 
 
 		 181 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  68.82 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  68.24 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  68.45 
 
 		 176 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  68.02 
 
 		 192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  64.09 
 
 		 196 aa  243  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  66.86 
 
 		 176 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  66.27 
 
 		 176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  67.2 
 
 		 190 aa  241  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  67.88 
 
 		 168 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  67.26 
 
 		 191 aa  239  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  62.92 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  63.28 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  65.29 
 
 		 176 aa  234  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  67.98 
 
 		 190 aa  231  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  61.4 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  61.99 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  62.28 
 
 		 184 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  59.88 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  59.88 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  56.74 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  62.03 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  58.43 
 
 		 194 aa  201  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  55.03 
 
 		 257 aa  187  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  51.45 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  37.91 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  35.42 
 
 		 164 aa  89  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  35.92 
 
 		 164 aa  88.6  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  33.56 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  35.21 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  34.51 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  34.51 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  34.25 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  34.93 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  34.51 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  31.94 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  33.8 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  33.82 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  28.87 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  27.66 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  27.66 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  27.46 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  34.51 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  28.28 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  34.07 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  32.14 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  28.17 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  34.31 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  32.62 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  34.75 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  30.88 
 
 		 275 aa  51.2  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  26.57 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2787  Ferritin and Dps  27.59 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  30.22 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  26.9 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  36.11 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  30.94 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  31.17 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  29.58 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  30.61 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  31.39 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  28.06 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  30 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  31.21 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  29.79 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  28.37 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  29.14 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  31.94 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  30 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  31.88 
 
 		 161 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  30.08 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  30.34 
 
 		 158 aa  48.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  34.72 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  33.55 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  31.51 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  29.53 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  26.71 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  32.61 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  28.67 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  28.17 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  28.95 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  28.08 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  32.09 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  32.09 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  29.41 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  29.58 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  32.61 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  29.73 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>