267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6426 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
174 aa  357  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  60.92 
 
 
181 aa  235  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  61.99 
 
 
185 aa  224  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  61.4 
 
 
185 aa  222  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  59.65 
 
 
196 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  58.24 
 
 
181 aa  214  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  57.4 
 
 
177 aa  208  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  56.8 
 
 
177 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  59.17 
 
 
187 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  58.58 
 
 
192 aa  204  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  57.65 
 
 
191 aa  202  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  54.71 
 
 
176 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  54.71 
 
 
176 aa  200  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  54.6 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  54.12 
 
 
179 aa  197  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  53.53 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  54.76 
 
 
180 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  53.29 
 
 
168 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  59.06 
 
 
190 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  57.83 
 
 
184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  56.79 
 
 
181 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  56.79 
 
 
181 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  60.23 
 
 
190 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  52.35 
 
 
186 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  55.06 
 
 
186 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  49.1 
 
 
194 aa  174  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  47.34 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  49.42 
 
 
257 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  37.87 
 
 
182 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  34.69 
 
 
164 aa  91.3  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  34.01 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  31.97 
 
 
164 aa  88.2  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 
164 aa  87.8  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
164 aa  84  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  31.29 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  26.9 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  31.91 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  29.66 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  31.39 
 
 
161 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  30.43 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  33.55 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  31.11 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  28.47 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  28.36 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  31.62 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  31.34 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  29.2 
 
 
159 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  31.39 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  31.72 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  30.6 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  31.72 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  29.14 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  28.99 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  30.66 
 
 
161 aa  57.4  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  28.47 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  29.58 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  30.56 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  27.74 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  30.15 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  28.78 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  29.2 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  29.41 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  26.76 
 
 
144 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  28.78 
 
 
159 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  29.93 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  29.5 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  29.93 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  36.36 
 
 
160 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  28.57 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  30.71 
 
 
183 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  30.6 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  30.6 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 
148 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  29.1 
 
 
157 aa  54.3  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 
184 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  29.08 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  32 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  29.2 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  29.08 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  30.23 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  32.45 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  28.28 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  32 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  29.85 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  31.33 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  32 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  29.85 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  29.1 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  29.5 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  29.1 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  28.78 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  28.15 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>