249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4906 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  93.85 
 
 		 180 aa  345  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  89.53 
 
 		 176 aa  318  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  86.63 
 
 		 176 aa  313  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  86.05 
 
 		 176 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  85.47 
 
 		 176 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  86.31 
 
 		 168 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  77.33 
 
 		 177 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  76.74 
 
 		 177 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  66.67 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  65.5 
 
 		 191 aa  241  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  63.28 
 
 		 185 aa  234  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  64.88 
 
 		 185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  63.69 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  59.22 
 
 		 196 aa  228  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  61.4 
 
 		 181 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  57.38 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  61.9 
 
 		 190 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  61.9 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  54.86 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  58.43 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  54.12 
 
 		 174 aa  197  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  57.14 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  57.14 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  55.35 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  58.23 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  52.98 
 
 		 257 aa  185  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  48.21 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  33.71 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  33.11 
 
 		 164 aa  84.7  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  34.44 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  33.1 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  33.57 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  35.71 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  31.03 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  32.17 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  30.61 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  34.44 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  34.31 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  34.51 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  34.07 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  34.59 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  33.08 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  27.94 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  30.77 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  34.81 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  35.33 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  36.03 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  35.29 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  34.07 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  34.07 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  32.33 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  36.09 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  33.09 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  32.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  35.56 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  32.33 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  33.1 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  35.29 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  34.81 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  33.58 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  33.08 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  33.08 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  33.08 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  32.59 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  34.59 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  28.67 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  33.58 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  33.1 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  31.69 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  35.92 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  31.58 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  31.91 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  32.62 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  29.63 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  32.86 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  33.08 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  32.37 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  31.88 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  35.04 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  35.04 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  35.04 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  32.86 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  32.86 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  32.86 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  33.08 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  34.29 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  33.78 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  31.34 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2621  Ferritin Dps family protein  30.52 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  29.37 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  31.34 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  29.32 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  30.99 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  32.33 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  28.38 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>