129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2621 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2621  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
149 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  66.91 
 
 
142 aa  186  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1160  hypothetical protein  56.82 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1034  hypothetical protein  53.47 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4269  hypothetical protein  53.47 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.552451  hitchhiker  0.0034156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0904  Ferritin Dps family protein  53.47 
 
 
146 aa  133  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0929  hypothetical protein  52.45 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0993  hypothetical protein  52.45 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1069  hypothetical protein  52.45 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64861e-38 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1087  hypothetical protein  52.45 
 
 
146 aa  127  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0914  hypothetical protein  52.45 
 
 
146 aa  127  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000508997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0897  hypothetical protein  52.45 
 
 
146 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.911937  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  42.97 
 
 
156 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  36.36 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  28.79 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  32.47 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  32.47 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  31.17 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  31.17 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  32.47 
 
 
191 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5174  Ferritin Dps family protein  35.53 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000150976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  30.52 
 
 
179 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  32.33 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
186 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  29.05 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  32.65 
 
 
181 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  31.11 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  30.41 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  31.45 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  33.77 
 
 
257 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  28.8 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  28.57 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  28.8 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  29.11 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  29.17 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  30.56 
 
 
194 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  27.7 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  30.99 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2787  Ferritin and Dps  27.27 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  29.41 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  27.4 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  29.45 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  30.16 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  26.85 
 
 
144 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  30.3 
 
 
160 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  28 
 
 
165 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  30.92 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  29.66 
 
 
164 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  29.37 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  29.37 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  27.4 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  31.75 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  30 
 
 
176 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4282  Ferritin and Dps  32.8 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000186191  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  29.6 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  31.5 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  30.95 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  26.4 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  31.51 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  30.92 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  33.05 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  30.53 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  27.2 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  32.77 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  34.13 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  30.53 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  29.87 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  27.2 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  33.96 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  26.35 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  28.38 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  29.41 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  27.2 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  30.94 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  26.98 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  31.16 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  28 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  28.8 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  28.8 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  30.95 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  30.5 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  28 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  25.6 
 
 
160 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  34.65 
 
 
158 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  25.6 
 
 
165 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  28.37 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  32.47 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  28 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  28.8 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  32.47 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  24.8 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  27.2 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  24.8 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  30.82 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4793  Ferritin Dps family protein  31.93 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.562748  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  25.6 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  32.14 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>