294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2171 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  100 
 
 		 176 aa  360  6e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4372  Ferritin Dps family protein  71.59 
 
 		 176 aa  261  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.156567 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3659  Ferritin Dps family protein  67.43 
 
 		 183 aa  244  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4282  Ferritin and Dps  68.02 
 
 		 180 aa  244  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000186191  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2450  Ferritin Dps family protein  66.86 
 
 		 183 aa  241  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  68.42 
 
 		 184 aa  241  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  66.86 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4793  Ferritin Dps family protein  66.67 
 
 		 175 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.562748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0570  ferritin Dps family protein  60.45 
 
 		 184 aa  220  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0710  Ferritin Dps family protein  41.95 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  40.23 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  40.12 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3489  Ferritin Dps family protein  39.08 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0943  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0999203  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2289  Ferritin Dps family protein  40.59 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0638834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0536  Ferritin Dps family protein  39.16 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2003  Ferritin Dps family protein  35.85 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.97873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0390  Ferritin Dps family protein  35.9 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.157325  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0173  Ferritin Dps family protein  30.36 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2165  Ferritin Dps family protein  33.58 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000673209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  28.76 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  27.74 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0172  Ferritin Dps family protein  31.14 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  29.19 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  28.97 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  28.97 
 
 		 146 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  27.85 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  30.14 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  28.28 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  28.97 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  28.97 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  28.28 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  28.28 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  28.28 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  28.28 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  28.28 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  28.28 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  26.11 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  26.58 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  26.92 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  25.32 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  26.39 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  27.81 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  26.38 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  28.29 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  26.71 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  28.29 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  27.03 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  28.29 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  28.85 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  28.48 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  30.2 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  30.99 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  31.37 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  28.03 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  24.84 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  27.81 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  28.95 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  24.84 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  26.14 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  28.57 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  28.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  28.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  24.84 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  32.82 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  30.26 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  30.26 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  30.26 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0191  DNA protection during starvation protein  28.47 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.139372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  28.29 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  26.97 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  28.29 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  25.66 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  27.22 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  27.63 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  27.81 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  30.26 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  29.61 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  27.15 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  27.59 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  35.71 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  28.29 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  29.8 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  35.71 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  35.71 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  35.71 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  27.27 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  25.62 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  35.71 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  35.71 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>