More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1541 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  83.12 
 
 		 161 aa  274  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  80.52 
 
 		 161 aa  270  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  54.9 
 
 		 157 aa  190  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0379  Ferritin Dps family protein  55.19 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  55.13 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  51.97 
 
 		 161 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  49.01 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  49.34 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  50.33 
 
 		 163 aa  170  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  48.37 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  54 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  53.33 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2381  DPS family protein  49.68 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  42.58 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4766  Ferritin, Dps family protein  44.52 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  43.31 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  42.68 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  37.84 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  37.09 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  38 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  38 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  38 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  37.33 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  37.33 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  37.33 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  36.42 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  37.33 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  40.69 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  36.42 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  36.42 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  38.56 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  36.42 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  39.29 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  37.91 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  35.33 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  37.09 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  36.42 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  35.33 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  35.76 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  35.76 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  35.76 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  33.97 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  37.25 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  35.1 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  36.24 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  38.57 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  35.66 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  36 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  39.29 
 
 		 147 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  35.48 
 
 		 157 aa  106  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  39.29 
 
 		 147 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  39.29 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  39.29 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  39.29 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  39.29 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  39.29 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  39.29 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  39.29 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  34.67 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  33.97 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  35.1 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  35.92 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  35.1 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  35.1 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  35.1 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  36.31 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  37.58 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  34.44 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  35.1 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  34.42 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  34.44 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  34.39 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  34.44 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  34.19 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  34.44 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  35.21 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  33.97 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  33.56 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  35.71 
 
 		 146 aa  101  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  35.71 
 
 		 146 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  35.71 
 
 		 146 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  34.44 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>