291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3841 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  100 
 
 		 156 aa  321  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  83.97 
 
 		 156 aa  277  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  82.69 
 
 		 156 aa  273  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  77.27 
 
 		 157 aa  257  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  77.56 
 
 		 156 aa  256  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  68 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  63.4 
 
 		 163 aa  213  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  63.82 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  66.45 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  66.45 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  66.45 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  66.45 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  63.82 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  66.45 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  66.45 
 
 		 162 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  66 
 
 		 162 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  65.33 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  65.79 
 
 		 162 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  65.79 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  63.82 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  63.82 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  63.82 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  65.33 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  63.58 
 
 		 161 aa  208  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  64.67 
 
 		 165 aa  207  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  62.5 
 
 		 164 aa  204  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1265  Ferritin, Dps family protein  64 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.758544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  62.67 
 
 		 157 aa  204  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  62.67 
 
 		 157 aa  204  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  63.33 
 
 		 158 aa  203  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  63.58 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  62.67 
 
 		 158 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  62.42 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  62.42 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  62 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  61.33 
 
 		 168 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  62.42 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  61.74 
 
 		 157 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0333  Ferritin and Dps  60.93 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3094  Ferritin Dps family protein  62 
 
 		 160 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0217734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  61.33 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  61.18 
 
 		 175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  59.33 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  61.33 
 
 		 166 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22760  Ferritin, Dps family protein  58.17 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51830  DNA-binding stress protein  65.33 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0248589  hitchhiker  0.0024179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4546  DNA-binding stress protein  65.33 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.632202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  60 
 
 		 160 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0665  ferritin and Dps  56.86 
 
 		 155 aa  190  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  62.5 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  56.29 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  56.95 
 
 		 172 aa  186  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  56.95 
 
 		 172 aa  186  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0325  Ferritin, Dps family protein  56.29 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2333  Ferritin, Dps family protein  56.29 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.62856  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  55.63 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2768  Ferritin Dps family protein  54.97 
 
 		 165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0223754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  56.86 
 
 		 201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5247  Ferritin, Dps family protein  56.95 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1219  Ferritin Dps family protein  57.33 
 
 		 168 aa  179  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  54.97 
 
 		 159 aa  179  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2879  Ferritin, Dps family protein  56.67 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  56 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  56 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  55.33 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0981  Ferritin, Dps family protein  55.33 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0902637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1046  Ferritin, Dps family protein  55.33 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.609194  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0985  Ferritin, Dps family protein  55.33 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.890442  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1158  Dps family protein  56 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  56 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  52.98 
 
 		 188 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  52.94 
 
 		 161 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  51.92 
 
 		 180 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  53.59 
 
 		 182 aa  170  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  52.29 
 
 		 181 aa  170  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2598  Dps family protein  52.63 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000451482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29571  Dps protein family protein  54 
 
 		 160 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  51.28 
 
 		 180 aa  166  8e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2148  Ferritin, Dps family protein  48.34 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0744  hypothetical protein  48.94 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0725  hypothetical protein  48.94 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1985  ferritin DPS family DNA-binding protein  44.22 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.596457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4078  Ferritin and Dps  49.65 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0913  Ferritin and Dps  49.65 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0256847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4306  Ferritin Dps family protein  46.71 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4600  Ferritin and Dps  44.2 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  41.56 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  41.29 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  42.38 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  40.65 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  41.22 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  41.72 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  40.13 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  39.35 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  41.06 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  37.91 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2721  Ferritin and Dps  37.25 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  38.67 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  40.91 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0131  DNA-binding stress protein  37.25 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>