286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2003 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2003  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
182 aa  363  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.97873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0390  Ferritin Dps family protein  69.23 
 
 
182 aa  236  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.157325  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0710  Ferritin Dps family protein  63.33 
 
 
181 aa  228  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2289  Ferritin Dps family protein  69.78 
 
 
181 aa  222  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0638834  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0536  Ferritin Dps family protein  62.22 
 
 
181 aa  220  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  60 
 
 
181 aa  208  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  58.89 
 
 
182 aa  204  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3489  Ferritin Dps family protein  58.33 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0173  Ferritin Dps family protein  42.29 
 
 
189 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0172  Ferritin Dps family protein  43.03 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4372  Ferritin Dps family protein  35.43 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.156567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4793  Ferritin Dps family protein  37.72 
 
 
175 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.562748  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5224  Ferritin Dps family protein  33.71 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2450  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3659  Ferritin Dps family protein  34.27 
 
 
183 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4282  Ferritin and Dps  36.08 
 
 
180 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000186191  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1894  Ferritin and Dps  34.29 
 
 
184 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0570  ferritin Dps family protein  33.71 
 
 
184 aa  99  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2171  starvation induced DNA binding protein  35.85 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.77873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0943  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0999203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2165  Ferritin Dps family protein  34.15 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000673209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  31.76 
 
 
222 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  32.92 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.73 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  31.48 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  29.03 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  28.76 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  32.33 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  29.66 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  29.66 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  29.61 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  33.77 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  32.89 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  29.8 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.88 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  28.66 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  29.03 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.15 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  31.41 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  29.33 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  31.94 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  31.94 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  31.94 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  31.94 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  31.94 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  31.94 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  30.34 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  31.94 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4342  Ferritin Dps family protein  32.56 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643085  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  31.94 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  31.94 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  28.57 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  31.94 
 
 
147 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  31.45 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2779  Ferritin, Dps family protein  29.05 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  30.34 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  29.71 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  33.63 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  30.77 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  28.97 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  30.65 
 
 
159 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  28.57 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  28.46 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.31 
 
 
177 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  29.23 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  29.23 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  36.13 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1007  Ferritin Dps family protein  27.74 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000417109  normal  0.0215471 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  28.35 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2946  Ferritin Dps family protein  35.19 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  33.58 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  29.73 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4815  Ferritin Dps family protein  29.77 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29571  Dps protein family protein  29.61 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  29.73 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  42.19 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  29.73 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  24.82 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  29.73 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  29.73 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  31.85 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2021  DNA-binding protein; DPS family protein  29.5 
 
 
158 aa  58.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  29.03 
 
 
161 aa  58.2  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1082  Ferritin Dps family protein  31.79 
 
 
155 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.500393  hitchhiker  0.000284805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3327  Ferritin Dps family protein  31.79 
 
 
155 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.818415  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3463  Ferritin Dps family protein  31.79 
 
 
155 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  25.64 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  31.13 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  29.49 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4607  Ferritin Dps family protein  31.01 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  29.69 
 
 
146 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  28.86 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>