More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4423 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  67.27 
 
 
177 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  64.33 
 
 
163 aa  203  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  55.62 
 
 
163 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  49.06 
 
 
176 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  54.14 
 
 
137 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  48.72 
 
 
158 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.2 
 
 
178 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.05 
 
 
181 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  52.03 
 
 
157 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  42.86 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.59 
 
 
165 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.22 
 
 
165 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.59 
 
 
165 aa  131  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  42.11 
 
 
160 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  46.15 
 
 
179 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  40.88 
 
 
164 aa  121  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.04 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.04 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.04 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.04 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.04 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.04 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.48 
 
 
167 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.65 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.65 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.48 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.65 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.12 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  45.45 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  36.25 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.8 
 
 
167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  48.84 
 
 
178 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  43.59 
 
 
158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  34.39 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  37.18 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  28.74 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.55 
 
 
160 aa  88.6  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.23 
 
 
158 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  38.69 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  28.31 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  29.71 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  31.91 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  36.08 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  31.91 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  31.21 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  32.69 
 
 
158 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  35.54 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  29.81 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  33.85 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  37.09 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  34.84 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  33.57 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  34.25 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  36.42 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  36.42 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  34.71 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  28.97 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  31.93 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  32.24 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  35.76 
 
 
162 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  33.1 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  30.59 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  30.5 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  34.21 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0319  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  32.35 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.26 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  28.28 
 
 
147 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  28.28 
 
 
147 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  34.07 
 
 
149 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  32 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  32.89 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  27.59 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  27.59 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  27.59 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  35.1 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  27.59 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  30.91 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  27.59 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  30.15 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>