285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  100 
 
 
158 aa  320  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  62.03 
 
 
158 aa  209  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  53.85 
 
 
157 aa  174  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  54.84 
 
 
159 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  48.68 
 
 
155 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  46.71 
 
 
155 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  44.74 
 
 
155 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  50.65 
 
 
155 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  48.37 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  45.65 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  43.8 
 
 
159 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  44.06 
 
 
149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  42.47 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  43.17 
 
 
162 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  45.65 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  42.96 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  42.96 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  42.96 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  42.65 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  40.58 
 
 
159 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  40.58 
 
 
176 aa  100  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  41.73 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  44.27 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  40.27 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  35.95 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.66 
 
 
178 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.66 
 
 
181 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.23 
 
 
188 aa  87.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  38 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  36.99 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  35.57 
 
 
179 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  35.57 
 
 
179 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  35.57 
 
 
179 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  36.96 
 
 
165 aa  84  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  35.17 
 
 
199 aa  84  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.24 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.91 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.68 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.33 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  37.33 
 
 
178 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  34.06 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  38.36 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  32.9 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.24 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  33.33 
 
 
137 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  35.51 
 
 
190 aa  79  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  35.14 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.33 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.33 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.33 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.33 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.33 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  31.51 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.8 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.33 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  29.33 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3998  hypothetical protein  34.58 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772382  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  31.93 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  30.97 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  31.93 
 
 
286 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  31.93 
 
 
284 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  31.93 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  31.33 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  29.73 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.33 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.33 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.33 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  31.13 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  32.09 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  30.58 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13178  DPS family protein  30.82 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  34 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.37 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  29.91 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  29.91 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  32.24 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  34.31 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.74 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.74 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4325  Ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  29.2 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  32.48 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  32.48 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  32.48 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0554  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30.56 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38419e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  32.48 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  32.48 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>