252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4171 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  91.61 
 
 		 284 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  92.16 
 
 		 286 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  38.41 
 
 		 167 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  35 
 
 		 155 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  32.85 
 
 		 155 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  36.3 
 
 		 158 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.88 
 
 		 188 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  32.41 
 
 		 155 aa  89.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  37.06 
 
 		 162 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  36.5 
 
 		 159 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  32.12 
 
 		 167 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 155 aa  85.9  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 159 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.51 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  34.51 
 
 		 159 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 		 162 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  34.97 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  34.97 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  36.23 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  34.56 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  36.92 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  32.39 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.71 
 
 		 163 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  31.85 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  30.72 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  32.39 
 
 		 165 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  32.69 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  32.69 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.92 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.9 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  30 
 
 		 159 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  30.37 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  32.69 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  30 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.09 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  30.33 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.79 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.21 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  31.17 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  27.74 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  29.87 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  35.48 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1226  Ferritin and Dps  30.32 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000988048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  35.48 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  29.22 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  35.48 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  32.26 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  32.26 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  32.26 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  32.26 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  29.14 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  33.68 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2338  Ferritin Dps family protein  25 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.301965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  32.84 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  29.68 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  34.41 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  35.48 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  35.48 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  34.41 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  34.41 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  29.68 
 
 		 166 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  34.41 
 
 		 162 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  30.71 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  27.33 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  27.74 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  28.21 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  29.17 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  26.44 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3998  hypothetical protein  38.04 
 
 		 115 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 		 170 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0853  Ferritin and Dps  29.01 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  29.7 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  29.33 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  33.33 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0595  Ferritin, Dps family protein  28.34 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  27.34 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  29.19 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  32.69 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  27.27 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  27.08 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  27.27 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  24.39 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  27.27 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  28.68 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  29.03 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  24.07 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  27.5 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3839  Ferritin Dps family protein  25.33 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.14 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>