More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2510 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  100 
 
 
177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  67.27 
 
 
188 aa  236  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  59.35 
 
 
163 aa  187  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  56.69 
 
 
163 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  50.64 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.2 
 
 
178 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  48.72 
 
 
158 aa  155  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  54.69 
 
 
137 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.58 
 
 
181 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  52.85 
 
 
157 aa  134  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.74 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  44.89 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.74 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  44.44 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.74 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.74 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.74 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.2 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.24 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.79 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.36 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.51 
 
 
167 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.51 
 
 
167 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.51 
 
 
167 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.51 
 
 
167 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.69 
 
 
167 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.69 
 
 
167 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  42.86 
 
 
165 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  45.27 
 
 
160 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  47.92 
 
 
178 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.27 
 
 
167 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.49 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  42.95 
 
 
158 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  49.61 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  36.69 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  35.29 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.23 
 
 
163 aa  84.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.68 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  34.51 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  34.51 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  34.51 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3834  Ferritin Dps family protein  35.98 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1392  Ferritin Dps family protein  34.36 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.349984  hitchhiker  0.00135993 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.21 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
204 aa  77.4  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  30.82 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.52 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  31.69 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  32.19 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  30.32 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  31.29 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  31.25 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  30.82 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  32.41 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  32.41 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0369  Ferritin Dps family protein  33.73 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0735152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0378  Ferritin, Dps family protein  33.73 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.291476  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  30.82 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  30.82 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  35.12 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  30.14 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  35.12 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  35.12 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  31.72 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  35.71 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  35.12 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  30.26 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  35.12 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  35.12 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  31.72 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  31.72 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  30.14 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  31.72 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  30.14 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  31.72 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  31.72 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  30.14 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  30.14 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  35.12 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  31.25 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  30.14 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  31.72 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  29.34 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  29.73 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  29.03 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>