287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0013 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  100 
 
 
159 aa  323  5e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  80.38 
 
 
159 aa  263  7e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  49.68 
 
 
190 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  51.3 
 
 
216 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  47.71 
 
 
182 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  45.22 
 
 
179 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  45.22 
 
 
179 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  45.22 
 
 
179 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  46.41 
 
 
182 aa  144  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  48.37 
 
 
185 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  47.1 
 
 
191 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  47.1 
 
 
187 aa  142  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  47.13 
 
 
163 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  46.05 
 
 
182 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  45.51 
 
 
199 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  45.39 
 
 
169 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.91 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.03 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.85 
 
 
167 aa  84  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.58 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.58 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.58 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.93 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.88 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.88 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.57 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.94 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.21 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.21 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.21 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.21 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.21 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.89 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.17 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  32.64 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.67 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.25 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  32.47 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  29.73 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  29.3 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  29.94 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.91 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  34.45 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  29.22 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  28.03 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  31.67 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  31.36 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  32.2 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  28.57 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  34.4 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  28.76 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.13 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  27.2 
 
 
146 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1214  Ferritin Dps family protein  29.61 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  26.49 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  27.15 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  30.66 
 
 
159 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  25.49 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  31.47 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  29.61 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  29.61 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0943  ferritin Dps family protein  25.47 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  25.5 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  30.92 
 
 
191 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  27.42 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  27.15 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0085  Ferritin Dps family protein  34.75 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  32.65 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  26.62 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  32.79 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  28.81 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  29.11 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  29.11 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  29.11 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  29.11 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  30 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  29.11 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  29.11 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  29.11 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  32.54 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  31.47 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  31.47 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3485  Ferritin, Dps family protein  28.39 
 
 
157 aa  57.4  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  28.03 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  33.61 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  27.46 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  28.48 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.95 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  29.6 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  31.5 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>