More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0735 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  51.59 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.98 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.68 
 
 		 181 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.86 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.37 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.7 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.92 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  42.86 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.24 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.89 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  41.91 
 
 		 137 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.65 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.32 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.54 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  47.65 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.54 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  44.63 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.01 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.01 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.01 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  40 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  39.42 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  39.86 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  35.29 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  34.64 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  34.64 
 
 		 179 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  33.11 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  36.96 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  31.13 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  31.79 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  38.52 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  35.16 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2320  Ferritin, Dps family protein  30.61 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  33.78 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  29.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  29.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  33.78 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  33.78 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  29.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  29.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  29.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  33.78 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  29.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  33.78 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  29.17 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01577  DNA-binding related protein  32.43 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2688  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119326  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  33.1 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  31.41 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  33.58 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  28.47 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  28.47 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  32.65 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  31.76 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  30 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.21 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  27.14 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  31.76 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  31.76 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0650  Ferritin Dps family protein  31.08 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  33.11 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  30.14 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0735  hypothetical protein  31.08 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  27.86 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  29.58 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  30.52 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  32.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2076  starvation-inducible DNA-binding protein  28.47 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602156  normal  0.30115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  31.97 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2466  Ferritin, Dps family protein  28.66 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  28.57 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3285  Ferritin Dps family protein  32.65 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>