285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0224 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 158 aa  320  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  62.03 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  61.54 
 
 		 157 aa  204  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  59.24 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  54.61 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  53.95 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  50.66 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  56.49 
 
 		 155 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  51.95 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  47.06 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  45.93 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  47.45 
 
 		 149 aa  124  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  44.14 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  44.85 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  45.19 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  42.96 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  44.12 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  44.12 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  44.12 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  44.12 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  45.93 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  45 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  45.07 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.89 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  40.44 
 
 		 181 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  43.51 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  35.71 
 
 		 182 aa  90.5  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  37.09 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  37.09 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  37.09 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  38.64 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  36.31 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  36.54 
 
 		 178 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.29 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  38.69 
 
 		 188 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  32.03 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.04 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  33.81 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.33 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  35.1 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  30.19 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.54 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3998  hypothetical protein  38.32 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  37.01 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  34.81 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  32.7 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.25 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  34.45 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  34.45 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  32.68 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  33.58 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  34.45 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.25 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.79 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.33 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  32.2 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.37 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.53 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.86 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  30 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  28.48 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.52 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.52 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.52 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  30.52 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.52 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.15 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.15 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.52 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.15 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  29.94 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  30.67 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  30.46 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  32.77 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.15 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  29.17 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  31.4 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  31.91 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  29.8 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  29.8 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  31.91 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  30.46 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  28.57 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  29.8 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  29.8 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  29.8 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>