275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0799 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  313  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  54.55 
 
 
155 aa  187  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  54.55 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  59.48 
 
 
155 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  50.66 
 
 
158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  52.67 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  50.67 
 
 
159 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  53.21 
 
 
157 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  44.74 
 
 
158 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  47.83 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  51.45 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  44.16 
 
 
162 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  44.76 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  44.52 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  42.66 
 
 
159 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  44.06 
 
 
162 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  41.26 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  44.06 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  44.06 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  39.86 
 
 
159 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  41.26 
 
 
167 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  42.57 
 
 
162 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  41.13 
 
 
170 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  39.44 
 
 
176 aa  97.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  36.24 
 
 
179 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  34.9 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  35.37 
 
 
199 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3998  hypothetical protein  40.95 
 
 
115 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772382  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  32.69 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  32.69 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  32.69 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  35.57 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5217  Ferritin Dps family protein  33.05 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.509359  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4692  Ferritin Dps family protein  33.05 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4171  Ferritin Dps family protein  32.2 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.33 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  34.06 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.82 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  35.1 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  33.33 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  32.19 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.61 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.43 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.11 
 
 
167 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.76 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.64 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.68 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  30.92 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  29.87 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  29.93 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  30.13 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.11 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  29.22 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  32.47 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  28.57 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.37 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.37 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.37 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  29.77 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  28.1 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  28.1 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  28.95 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  31.82 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  28.95 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0327  Ferritin Dps family protein  26 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743454  hitchhiker  0.00750622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2914  Ferritin Dps family protein  26.67 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.319607  hitchhiker  0.00000000175799 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  38.82 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  28.1 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  28.85 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  26.92 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.21 
 
 
188 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  27.92 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  29.33 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.41 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  28.86 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4607  Ferritin Dps family protein  29.33 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0554  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  26.39 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38419e-16 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  27.45 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.41 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  27.66 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  28.1 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>