290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05670  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  100 
 
 
176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  66.19 
 
 
159 aa  194  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  64.34 
 
 
159 aa  191  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0334  Ferritin, Dps family protein  60.14 
 
 
159 aa  178  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  58.33 
 
 
162 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3028  Ferritin and Dps  58.97 
 
 
162 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3087  Ferritin, Dps family protein  58.97 
 
 
162 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0395756  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  55.28 
 
 
167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  55.13 
 
 
167 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0554  Ferritin Dps family protein  61.54 
 
 
159 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  55.17 
 
 
162 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4280  Ferritin Dps family protein  51.27 
 
 
170 aa  161  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.036525  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  45.93 
 
 
158 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  45.45 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  40.58 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  39.44 
 
 
155 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  38.52 
 
 
159 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  38.06 
 
 
155 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  38.81 
 
 
155 aa  97.4  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  38.52 
 
 
157 aa  97.4  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  38.84 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  35.62 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  35.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  34.97 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  34.97 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  34.97 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  36.81 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  35 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  36.73 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  36.11 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4661  Ferritin Dps family protein  32.39 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  31.65 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  35.2 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4342  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643085  normal  0.793177 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  32.5 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4674  Ferritin Dps family protein  31.69 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  31.16 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4607  Ferritin Dps family protein  31.37 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.61 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  30.82 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.43 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  33.33 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  31.16 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  32.85 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2872  Ferritin and Dps  30.77 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.146196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  36.43 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  32.88 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3841  Ferritin and Dps  34.04 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000127863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  32.84 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4770  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181965  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  29.58 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5237  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  30.43 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  31.65 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  27.33 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0619  Ferritin Dps family protein  29.45 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1191  Ferritin Dps family protein  31.03 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.400425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  34.17 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4005  Ferritin Dps family protein  32.85 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1535  Ferritin Dps family protein  29.22 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146726  normal  0.305527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  31.43 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  33.57 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5312  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158594  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  33.1 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1840  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2099  Ferritin Dps family protein  30.95 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1210  DNA-binding stress protein, putative  32.61 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1239  Ferritin, Dps family protein  32.61 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.698815  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4208  Ferritin Dps family protein  32.61 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.857368  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4157  Ferritin Dps family protein  30.14 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00577  putative DNA-binding stress protein  32.14 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1014  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174002  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  32.37 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  31.43 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0140  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.572048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  31.43 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  32.41 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4414  Ferritin and Dps  31.65 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0174703  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3834  Ferritin and Dps  27.46 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183846  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  27.54 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  32.88 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2045  Ferritin, Dps family protein  36.28 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0289299  normal  0.419788 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6002  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  37.06 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  28.76 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  31.21 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2779  Ferritin, Dps family protein  29.01 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427628  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3732  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2940  Ferritin and Dps  31.72 
 
 
161 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.062386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>